学术报告(邓明华 10.15)

基于深度学习的生物信息学应用

发布人:杨晓静 发布日期:2020-10-14
主题
基于深度学习的生物信息学应用
活动时间
-
活动地址
平台:腾讯会议 收听账号及密码:740 168 300
主讲人
邓明华教授 北京大学数学科学学院
主持人
张家军

摘要:

       本报告将介绍本课题组近期开发的几个深度学习生物信息应用。一个应用是DNA和蛋白质结合的研究,我们将EM算法的思想应用于CNN模型中,提高了DNA-蛋白质结合的预测效果;同时在模型中引入剪枝方法,提高了CNN模型中卷积核的可解释性。另一个应用是单细胞测序数据的聚类和标注,融合聚类和基于深度学习的降维方法,开发了聚类方法sciDesk;进一步结合对比学习的思想,开发了标注方法scAnCluster.